Цисты патогенных кишечных простейших — промежуточный этап развития паразитов, наблюдающийся во время перехода от носителя к носителю. Это состояние ожидания, которое может перейти в заражение.
В организм цисты попадают с сырой водой, некачественной пищей, из-за нерегулярного удаления из помещения подстилки с пометом.