С 2002 по 2004 годы Рафаил Газизович являлся главным тренером молодежной сборной России. С 2006 года он преподает в национальном государственном университете физкультуры, спорта и здоровья имени Лесгафта, является спортивным директором специализированно детско-юношеской школы олимпийского резерва СКА.
Сегодня, в день рождения Рафаила Ишматова, глава республики вручил ему орден Салавата Юлаева.
— Вы очень много сделали для советского и российского спорта. И, конечно, внесли огромный вклад в развитие башкирского хоккея, — отметил Радий Хабиров. — Наши спортсмены и болельщики относятся к вам с огромным уважением.