Бауыржан Кудайбергенов родился в 1988 году.
Он окончил Евразийский национальный университет имени Л. Н. Гумилёва, Южно-Казахстанский государственный университет имени М. Ауэзова, Университет Манчестера (Великобритания), Назарбаев Университет.
Трудовую деятельность начал инспектором отдела анализа и информатизации Счётного комитета по контролю за исполнением республиканского бюджета.
В 2012—2017 годы работал экспертом-аудитором, главным экспертом-государственным аудитором Счётного комитета по контролю за исполнением республиканского бюджета.
В 2018—2022 годах занимал различные должности в отделе социально-экономического мониторинга Администрации президента РК, отделе информационно-аналитического обеспечения Канцелярии первого президента РК.
С февраля 2022 года по настоящее время занимал должность советника премьер-министра.
Кудайбергенов является обладателем стипендии «Болашак», членом президентского молодёжного кадрового резерва 2021 года.
