Как сообщает «РБК-Пермь», ему было инкриминировано десять преступлений, среди которых нарушение неприкосновенности частной жизни, неправомерный доступ к компьютерной информации, разглашение гостайны, а также получение взятки. По версии СКР, господин Агафонов передавал служебную информацию представителям коммерческих организаций.
Рассмотрение дела проходило в закрытом для СМИ режиме. К какому наказанию был приговорен Андрей Агафонов, неизвестно, но он был взят под стражу в зале суда.